Dans le cadre de sa vision émancipatrice de l’école le SNETAP soutient toutes les initiatives visant à combattre les stéréotypes de genre et à promouvoir une réelle égalité garçons-filles.

Il dénonce les attaques réactionnaires portées par de nombreux groupes et représentants politiques proches ou membres de la manif pour tous, visant à stigmatiser les individus en fonction de leur sexe, de leur genre ou de leur sexualité.